復旦大學附屬閔行醫院創建于1969年。1995年成為二級甲等綜合性醫院。2000-2014年為上海瑞金醫院集團成員單位。2014年閔行區人民政府與復旦大學合作共建，籌建復旦大學附屬醫院。2017年簽約組建“中山醫院-閔行區中心醫院閔行醫療聯合體”，成為復旦大學附屬中山醫院閔行分院。2018年正式列為復旦大學附屬醫院。2020年成為三級乙等綜合性醫院。經過50余年的發展，醫院現占地面積5.89萬平方米，建筑面積10.74萬平方米。全院核定床位800張，實際開放床位1000余張。擁有3.0T核磁共振、第三代雙源CT（FORCE）、飛利浦FD20 DSA機等大型醫療設備。醫院科室設置齊全，現有臨床、醫技科室43個。2019年門急診290萬人次，出院5.1萬人次，手術3.1萬人次，平均住院天數7.01天。現有職工2000余人，其中專業技術人員1400余人，中高級職稱近800人，博士、碩士300余人，近300人取得教師資格證書。

2013年經國家食品藥品監督管理總局批準，醫院取得藥物臨床試驗機構資格（GCP），現有專業組10個。心內科、急診科、婦科、內鏡中心、藥劑科先后成為上海市醫學重點專科，內鏡中心、骨科為閔行區大學科（在建），還有多個區特色專科，同時醫院仍在不斷加大院級重點學科建設力度。醫院急診力量雄厚，2009年被認定為上海市急性創傷急救中心，2018年通過全國胸痛中心認證，也是閔行區腦卒中臨床救治中心，2019年獲批成立上海市衛健委消化腫瘤全周期監測與精準干預重點實驗室。與復旦大學共建以來，建成上海市醫療系統首家、體制內首家院士專家工作站，顧玉東、周良輔和葛均波三位院士帶領專家團隊來院指導。醫院還加入了復旦大學兒科、婦產科醫聯體，建立宮頸疾病診治專科-紅房子專家團隊工作室。醫院還建成了周平紅教授“大國工匠”內鏡工作站，復旦大學生物醫學研究院閔行分院、復旦大學生物醫學研究院康復醫學研究中心、上海市臨床生物信息研究所腫瘤生物信息研究中心、上海市消化內鏡工程技術研究中心閔行分中心、上海復旦臨床病理診斷中心-閔行區疑難病理會診平臺。醫院還是“全國綜合性醫院中醫藥工作示范單位”。目前簽約64名來自復旦大學附屬中山醫院、華山醫院、婦產科醫院、兒科醫院等特聘顧問、學術主任，服務百姓同時帶動醫院發展。2014年至今，醫院共取得國家自然科學基金項目27項、上海市科委基金18項，上海市衛健委項目22項，閔行區科委項目137項。榮獲國家級科學技術進步獎二等獎1項，上海市科學技術進步獎二等獎1項，上海醫學科技獎三等獎2項，上海市科委青年英才揚帆計劃2人，上海市銀蛇獎提名獎1人。2014年至今共發表核心期刊論文1000余篇，SCI論文近300篇，獲得國家發明專利授權2項，實用新型專利授權6項，舉辦國家級繼續教育項目43項，上海市繼續教育項目20項。2014年成為復旦大學研究生培養單位，現有復旦大學博士研究生導師6名，碩士研究生導師14名。醫院是上海市第一批住院醫師規范化培訓基地，現有專業基地10個。醫院承擔了復旦大學、溫州醫科大學的本科生理論授課工作以及復旦大學、上海中醫藥大學、溫州醫科大學等多所醫學院校的本科生實習任務。

醫院積極響應醫改號召，加強區域醫療聯動，推進資源整合，設立區域會診中心，承擔周邊7家社區衛生服務中心的業務幫扶工作，開展PACS、MUSE、眼底鏡會診等業務協作，協助管理雙向轉診床位110余張。醫院積極完善與120院前院內急救聯動機制，實現急救無縫銜接。積極參與承擔援摩、援疆、援滇等醫療任務。醫院還承擔了多項國家級、市級重大活動的醫療保障工作，是進博會定點醫院。1997年起，連續榮獲“上海市文明單位”和“上海市衛生系統文明單位”稱號。醫院現已成為立足閔行、輻射上海市西南區域的醫療中心。

醫院將充分發揮復旦大學附屬醫院的品牌、管理、技術和人才優勢，全面提升醫療、教學和科研能級，建設成為基礎學科較為齊全扎實，特色專科優勢較為明顯，管理精細、服務優良的三級綜合性醫院和區域醫療中心。