北京延慶區疾控中心（北京市延慶區疾病預防控制中心、延慶區職業病診斷鑒定委員會辦公室）是一家經國家衛生部門批準成立的一家集醫療、臨床、預防、保健、科研于一體的預防、職業衛生檢測、環境檢測等項目綜合性公立疾病預防控制中心，是從事基本公共衛生服務的公益性事業單位。

北京市延慶區疾病預防控制中心成立于2005年4月1日，是隸屬于北京市延慶區衛生和計劃生育委員會的事業單位。中心占地面積12429平方米，建筑面積6117平方米。擁有氣相色譜-質譜聯用儀、離子色譜儀、流動注射分析儀、全自動毛細管電泳儀、全自動酶免分析儀、實時熒光定量PCR擴增儀、全自動生化分析儀、全自動微生物鑒定系統等各種檢測設備200余件。目前，已通過了北京市技術監督局計量認證，能夠依法開展各類衛生檢驗、監測、疾病預防控制及科研培訓工作。

2020年9月，被中共北京市委、北京市人民政府評為：北京市抗擊新冠肺炎疫情先進集體。