新杭鎮中心衛生院負責本鄉鎮的衛生工作法律、法規、政策的貫徹，衛生事業發展規劃和工作計劃的制訂，社會公共衛生工作的組織和實施；負責本鄉鎮的基本醫療服務；負責本鄉鎮突發公共衛生事件的報告，并依據上級部門要求組織實施處置；負責本鄉鎮轄區內的衛生信息統計、分析、上報；負責對本鄉鎮轄區內村級衛生組織和鄉村醫生的業務指導和培訓；負責承辦政府衛生行政部門委托的相關業務或事項;負責上級衛生行政部門下達的其他工作。貫徹執行黨的衛生計生工作方針政策和國家衛生法律、法規，以公共衛生服務為主，面向農村居民提供綜合性衛生服務，受上級衛生行政部門委托承擔轄區內預防保健、基本醫療、健康教育、康復和計劃生育技術等工作。